Fethiyespor, 1933 senesinde 8 kişilik yönetim kurulu ve Nevzat Yergüz’ün önderliğinde Fethiye’de kuruldu. Başlarda futbol takımının ismi birkaç kez değişime uğrasa da renkleri daima beyaz ve lacivert olarak kaldı. Yalnızca sonradan kırmızı renk aralarına eklendi.
Fethiyespor’un bölgedeki adı “Akdeniz’in Şimşekleri”dir. Takım, kuruluşundan 51 yıl sonra, 1984 senesinde ilk defa profesyonellerin oynadığı lige ayak bastı. O zamandan beri de bir daha amatör lige gerilemedi.
1994-1995 döneminde 2. Lige çıkan Fethiyespor, tarihinde en büyük başarısını bu şekilde kazanmış oldu. Fakat ne yazık ki 1995-1996 döneminde 3. Lige döndü.
2001-2002 döneminde 3. Ligde kalmak için zorlu mücadele veren Fethiyespor, binlerce taraftarıyla Fethiye Stadında son maç mücadelesi verdi. Taraftarlarının üstün desteği ve futbolcularının zorlu mücadelesi sonucunda 1 gol bulan takım, amatör lige düşmekten son saniyelerde kurtuldu.
2005-2006 döneminde tekrar 2. Lige çıkmayı başaran Fethiyespor, 2012 senesine kadar burada mücadele etmiştir. 2012-2013 döneminde ise 1. Lige çıkmayı başarmıştır. Bu durum, takım için mükemmel bir başarı olmuştur. Fakat bu başarıya rağmen takım, 2013-2014 dönemi sonunda alt lige düşmekten kurtulamamıştır.
2019-2020 döneminde ise başarısızlıkları sonucunda bir alt lige daha gerileyen takım, halen 3. Ligde mücadele vermektedir.